1998
12月
- 大学設置認可
- 理事長・総長 加計 勉 学長 名東 孝二 就任
1999
4月
- 社会福祉学部（東洋介護福祉学科・社会福祉計画学科・臨床福祉学科）
- 保健科学部（作業療法学科・言語聴覚療法学科・視機能療法学科）の総合大学として開学
2001
1月
2002
4月
- 学長に田原 直廣 就任
- 通信教育部社会福祉学部 臨床福祉学科 開設
- 大学院（通信制）社会福祉学研究科 修士課程 開設
- 大学院（通信制）保健科学研究科 修士課程 開設
2003
4月
- 薬学部薬学科開設
- 大学院 社会福祉学研究科 修士課程 開設
2004
4月
- 大学院（通信制）社会福祉学研究科 博士（後期）課程 開設
- 大学院（通信制）保健科学研究科 博士（後期）課程 開設
- 社会福祉学部 社会福祉計画学科をスポーツ健康福祉学科、福祉環境マネジメント学科に改組
12月
- 宮崎県立延岡高等学校・宮崎県立延岡星雲高等学校・宮崎県立延岡工業高等学校・宮崎県立延岡青朋高等学校・宮崎県立延岡商業高等学校・延岡学園高等学校と連携協力協定を締結
2006
4月
- 学長に南嶋 洋一 就任
- 薬学部薬学科を6年制に移行、入学定員を200名に増員
2007
4月
- 社会福祉学部臨床福祉学科に、臨床福祉専攻、臨床介護専攻、動物療法専攻を設置
- 社会福祉学部 子ども保育福祉学科を開設
- 保健科学部 臨床工学科を開設
2008
4月
- 社会福祉学部臨床福祉学科に、福祉ビジネス専攻を設置
- 薬学部に動物生命薬科学科を開設
- 大学院（通信制）社会福祉学研究科社会福祉学専攻博士（後期）課程を（通信制）連合社会福祉学研究科社会福祉学専攻博士（後期）課程と名称変更し、吉備国際大学大学院との連合研究科を開設
2009
1月
- フィリピン国立大学ロス・バニョス校（フィリピン）と教育交流協定を結ぶ
4月
- 社会福祉学部臨床福祉学科臨床介護専攻を改編し、臨床心理専攻を開設
- 吉備国際大学大学院（通信制）国際協力研究科を（通信制）連合国際協力研究科と名称変更し、九州保健福祉大学との連合研究科を開設
- 聖心ウルスラ学園高等学校と連携協力協定を締結
5月
- 九州保健福祉大学開学10周年記念式典挙行
- 創立者加計勉記念室を開設
- 石井記念友愛社・みその児童福祉会・高梁学園による「児童養護施設卒園者を支援する」連携協力協定を締結
- 延岡市・高梁市・高梁学園による「大学を活かしたまちづくり」連携協力協定を締結
9月
2010
4月
- 学長に和田 明彦 就任
- 学校法人高梁学園を学校法人順正学園に名称変更
- 視機能療法学別科を開設
9月
- 宮崎県立門川高等学校・宮崎県立都農高等学校と連携協力協定を締結
2011
1月
12月
- 神奈川歯科大学と教育・学術交流に関する連携協定を結ぶ
2012
4月
- 大学院(通学制）医療薬学研究科医療薬学専攻博士課程(4年)を開設
- 臨床工学別科を開設
- 延岡しろやま支援学校と連携協定を結ぶ
12月
- 延岡警察署と「災害時における警備活動の拠点提供に関する覚書」を締結
2014
4月
- 学長に迫田 隅男 就任
- スポーツ健康福祉学科に「鍼灸健康福祉コース」を開設
2015
4月
8月
- 延岡市・宮崎市・日向市・高鍋町・門川町と順正学園が子ども支援に関する協定を締結
2016
7月
2017
1月
2月
11月
2018
4月
2020
4月
- 学長に兒玉 修 就任
- 臨床心理学部臨床心理学科「心理・福祉コース」「言語聴覚コース」を開設
- 生命医科学科に「臨床検査技師コース」「臨床工学技士コース」「ダブルライセンスコース」を開設
6月
2021
6月
2022
4月
- 大学院（通信制）連合社会福祉学研究科社会福祉学専攻博士（後期）課程を（通信制）社会福祉学研究科社会福祉学専攻博士（後期）課程に名称変更し、併せて（通信制）社会福祉学研究科社会福祉学専攻修士課程を（通信制）社会福祉学研究科社会福祉学専攻博士（前期）課程へ名称変更
2023
9月
10月
- 日本救急システム株式会社と産学連携に関する包括協定を締結
11月
- 宮崎県立高千穂高等学校・宮崎県立五ヶ瀬中等教育学校と連携協力協定を締結
2024
4月
- 九州医療科学大学へ校名変更
- 学長に池ノ上 克 就任
- 大学院（通信制）保健科学研究科を大学院（通信制）保健医療学研究科に名称変更
- スポーツ健康福祉学科に「救急救命コース」「スポーツ科学コース」「鍼灸健康コース」「ソーシャルワークコース」を開設
- 通信教育部に「ハイブリッドコース」を開設
